Identificação de novos alelos HLA gerados por diferentes mecanismos genéticos
Os loci HLA estão entre os genes mais polimórficos do genoma humano. A diversidade HLA é gerada por diferentes mecanismos genéticos, como mutação de ponto por substituição de nucleotídeo (SNP) ou inserção/deleção, conversão gênica e crossing-over. Novos alelos HLA têm grande interesse clínico por serem importantes no contexto dos transplantes, pois a probabilidade de complicações aumenta com a disparidade HLA. Durante a rotina de tipificação HLA no IMUNOLAB, foram identificadas 29 novas sequências HLA descritas nesse estudo.
Vinte e nove novos alelos foram identificados por sequenciamento HLA (Classe I exons 2, 3, 4 e Classe II exons 2 e 3) por kits Group Specific Domino Stone (Protrans, Alemanha) em indivíduos da população de Minas Gerias cujas sequências foram depositadas no GenBank e nomeadas pela Organização Mundial de Saúde.
Vinte e quatro novos alelos foram gerados por SNP dos alelos mais comuns dos seus grupos. Destes, quatro sequências apresentaram SNP sinônimo: A*29:01:08, DR1*04:11:03, DRB1*11:04:14, DQB1*03:02:20. Outras 20 sequências foram geradas por SNP não sinônimo: A*33:117, A*80:03, B*07:184, B*40:331, B*40:343, B*41:27, B*42:19, B*42:20, B*42:24, B*50:32, B*50:48, B*51:151, B*57:63, B*57:64, B*58:42, DRB1*01:74, DRB1*10:05, DRB1*15:94, DRB1*16:22 e DQB1*03:243. O alelo nulo HLA-A*02:643N resultou de um SNP que levou a mudança na janela de leitura com subsequente geração de um stop codon. Quatro novos alelos HLA, B*14:56, B*27:102, B*41:48 e B*53:44, foram provavelmente produtos de conversão gênica intralocus.
Diferentes mecanismos genéticos contribuem para a geração do polimorfismo HLA exigindo especialistas atentos e rigorosos nas análises das tipificações HLA e o emprego de diferentes metodologias para a identificação das novas mutações.
Novos alelos HLA
Imuno/Histo/Tecidos
Faculdade de Ciências Médicas - Minas Gerais - Brasil, IMUNOLAB Histocompatibilidade - Minas Gerais - Brasil
Raquel Aparecida Fabreti-Oliveira, Evaldo Nascimento